Development of Species-Specific Microsatellite Markers for Broomcorn
Millet (Panicum miliaceum L.) via High-Throughput Sequencing

Min-Xuan Liu; Yue Xu; Tian-Yu Yang; Zhi-Jun Qiao; Rui-Yun Wang; Yin-Yue Wang; Ping Lu

ISSN: 2329-8863

Достижения в области растениеводства и технологий

Открытый доступ

Наша группа организует более 3000 глобальных конференций Ежегодные мероприятия в США, Европе и США. Азия при поддержке еще 1000 научных обществ и публикует более 700 Открытого доступа Журналы, в которых представлены более 50 000 выдающихся деятелей, авторитетных учёных, входящих в редколлегии.

Журналы открытого доступа набирают больше читателей и цитируемости
700 журналов и 15 000 000 читателей Каждый журнал получает более 25 000 читателей

Публикационная политика и этика

Индексировано в

Индекс источника CAS (CASSI)
Индекс Коперника
Google Scholar
Шерпа Ромео
Онлайн-доступ к исследованиям в области окружающей среды (OARE)
Открыть J-ворота
Академические ключи
ЖурналТОС
Доступ к глобальным онлайн-исследованиям в области сельского хозяйства (AGORA)
РефСик
Университет Хамдарда
ЭБСКО, Аризона
OCLC- WorldCat
научный руководитель
Онлайн-каталог SWB
Публикации
Евро Паб

Посмотреть больше

Полезные ссылки

Журналы открытого доступа

Посмотреть больше

Поделиться этой страницей

Абстрактный

Development of Species-Specific Microsatellite Markers for Broomcorn Millet (Panicum miliaceum L.) via High-Throughput Sequencing

Min-Xuan Liu, Yue Xu, Tian-Yu Yang, Zhi-Jun Qiao, Rui-Yun Wang, Yin-Yue Wang and Ping Lu

Objectives: To discover and develop large-scale SSR markers of the P. miliaceum genome, which can be used in future genetic studies effectively.

Result: 223,894 putative SSR sequences were identified by next-generation sequencing. A total of 56,694 primer pairs were successfully designed and 240 primer pairs were randomly selected for effectiveness validation. The expected heterozygosity and observed heterozygosity varied from 0.0447 to 0.7713 and from 0 to 0.9545, respectively and the mean of Shannon information index (I) was 0.7254. A UPGMA dendrogram indicated the high quality and effectiveness of these novel genomic SSR markers developed via next-generation sequencing technology.

Conclusion: A large repertoire of SSR markers were successfully developed by next-generation sequencing of the P. miliaceum genome which will be useful for the construction of genetic linkage maps, the identification of QTLs, and marker-assisted selection breeding.